Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf123Q5XPI3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rnf123Q5XPI3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf123Q5XPI3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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