Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LpoQ5SW46 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms