Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp18Q5SSI6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms