Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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