Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim58Q5NCC9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Trim58Q5NCC9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim58Q5NCC9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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