Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms