Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2Q3V1H1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms