Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc185Q3V118 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc185Q3V118 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms