Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp48Q3V0C5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Usp48Q3V0C5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms