Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pfdn4Q3UWL8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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