Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm6899Q3USS0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms