Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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