Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms