Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Rmi2Q3UPE3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms