Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc33Q3ULW6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc33Q3ULW6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc33Q3ULW6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc33Q3ULW6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc33Q3ULW6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc33Q3ULW6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc33Q3ULW6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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