Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q3UJP5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q3UJP5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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