Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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