Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf224Q3UIW8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf224Q3UIW8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms