Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lrrc58Q3UGP9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc58Q3UGP9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lrrc58Q3UGP9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc58Q3UGP9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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