Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nom1Q3UFM5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nom1Q3UFM5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms