Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms