Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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