Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms