Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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