Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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