Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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