Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf149Q3U2C5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms