Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ccndbp1Q3TVC7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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