Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms