Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Fam178bQ24JP3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Fam178bQ24JP3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms