Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms