Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms