Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TrioQ0KL02 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms