Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms