Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnma1Q08460 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnma1Q08460 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnma1Q08460 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnma1Q08460 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnma1Q08460 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnma1Q08460 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnma1Q08460 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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