Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MestQ07646 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MestQ07646 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MestQ07646 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms