Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms