Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms