Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms