Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacna1sQ02789 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms