Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RykQ01887 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RykQ01887 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RykQ01887 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms