Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
VcpQ01853 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms