Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms