Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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