Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms