Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gabpb1Q00420 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gabpb1Q00420 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gabpb1Q00420 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gabpb1Q00420 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gabpb1Q00420 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gabpb1Q00420 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gabpb1Q00420 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gabpb1Q00420 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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