Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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