Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ccl21cP86793 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccl21cP86793 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccl21cP86793 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccl21cP86793 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl21cP86793 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl21cP86793 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl21cP86793 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl21cP86793 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl21cP86793 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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