Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ptprn2P80560 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ptprn2P80560 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ptprn2P80560 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ptprn2P80560 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ptprn2P80560 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ptprn2P80560 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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