Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms